CSIRO 的研究人员对夜鹦鹉(Pezoporus occidentalis)的第一个基因组进行了测序,夜鹦鹉是世界上最稀有、最难以捉摸的鸟类之一。
夜鹦鹉是澳大利亚特有的相对较小的短尾鹦鹉物种。
该物种也被称为豪猪鹦鹉、夜间地面鹦鹉、午夜凤头鹦鹉、独角鹦鹉、三刺鹦鹉和夜间鹦鹉,该物种由英国鸟类学家约翰·古尔德于 1861 年首次描述。
夜鹦鹉是世界上最难以捉摸、最神秘的鸟类之一,1912 年至 1979 年间没有任何证实的目击事件。
这种鸟曾经在干旱的澳大利亚广泛分布,但由于环境变化(例如猫和狐狸的捕食)而数量减少。
现在仅在昆士兰州西南部和西澳大利亚州的局部地区才知道它。
“在 19 世纪收集了几十个科学标本,在 1912 年收集了一个。然后于 1990 年在昆士兰州西南部发现了一个标本,”CSIRO 澳大利亚国家野生动物收藏中心主任 Leo Joseph 博士说。
“2013 年,同一地区报告有活鸟出现,2015 年终于捕获并标记了一只活鹦鹉。”
他补充说:“基因组将使我们能够探索夜鹦鹉夜间活动的遗传基础,这是鹦鹉中非常不寻常的特征。”
“我们将研究导航、嗅觉、喙形状及其不太理想的夜视能力。”
“研究人员还将能够对该个体的基因组进行统计分析,以估计澳大利亚夜鹦鹉种群过去的种群规模。”
“现在,我们有能力将这个带注释的基因组与其他密切相关的鹦鹉进行比较,揭示其与许多亲戚相比稀缺和分布有限的原因。”
约瑟夫博士和同事利用从皮尔巴拉地区发现的标本中获得的组织对夜鹦鹉的基因组进行了测序。
“CSIRO 应用基因组学计划下的高通量测序技术正在加速澳大利亚的基因组学研究,”CSIRO 环境部夜鹦鹉基因组学项目负责人 Gunjun Pandey 博士说。
“我们现在可以从非常小的组织样本中生成非常高质量的基因组——甚至小到蚂蚁的头部或一只蚊子。”
“即使在五年前,这种质量和细节水平也是不可能的。”
“遗传数据可用于确保保护计划最大限度地发挥多样性,因此该物种具有复原力,并且具有长期生存的最佳机会。”
虽然夜鹦鹉基因组是了解更多关于这种鸟类的令人兴奋的科学资源,但保护该物种免受猫、狐狸、火灾和栖息地丧失的影响对于它们的保护也至关重要。
“夜鹦鹉基因组将为进一步研究提供大量机会,以帮助保护这个物种,”潘迪博士说。
“这将使科学家能够制定拯救夜鹦鹉的计划,这是对基因组进行测序并将其公开的最终目标。”