任何癌症的进展不仅取决于肿瘤本身的分子特征，还取决于肿瘤与其周围细胞的相互作用。然而，了解肿瘤微环境中的这些相互作用到底如何影响疾病的进程一直很难研究。

在一项新研究中，耶鲁大学和伦敦大学学院的研究人员分析了 2,500 多种类器官或实验室制作的肿瘤模型及其微环境(源自患者细胞)对各种癌症治疗的反应所发生的分子相互作用。患有结肠癌。

研究人员能够确定肿瘤与周围组织之间的特定相互作用，这有助于预测个体癌症患者的预后，并为最有可能对他们有益的治疗提供信息。

研究结果于 12 月 7 日发表在《细胞》杂志上。

耶鲁大学医学院遗传学和计算机科学副教授、该研究的共同高级作者Smita Krishnaswamy表示：“这项研究帮助我们了解肿瘤从哪里开始，以及治疗是否会导致它们产生化疗耐药性和化疗敏感性。”

所有癌症在分子上都是不同的，其范围从相对无威胁到可能致命。结果通常取决于肿瘤的微环境或癌症周围的细胞。然而，评估肿瘤与这些周围细胞之间相互作用过程中发生的分子事件，并确定哪些可能导致良好的预后或不良的预后，一直是很困难的。

在这项新研究中，研究人员从患者的肿瘤中采集细胞来开发类器官。然后，他们开发了一个质谱流式分析平台，使他们能够测量类器官中重要的分子线索，例如 DNA 损伤水平、细胞周期活性和细胞亡，以响应治疗。

他们使用了 Krishnaswamy 实验室开发的一种名为 TRELLIS 的数据分析工具，该工具使他们能够在单细胞水平上分析类器官对各种治疗(例如化疗)的反应。

他们发现，一个有趣的结果是，来自癌症肿瘤周围健康细胞的 YAP(yes 相关蛋白)信号传导——Hippo 信号传导网络的关键部分，控制器官生长，实现细胞间通信——实际上可以共同保护肿瘤免受化疗等治疗。他们说，这一发现表明抑制这些信号的疗法可能是有益的。

但当他们评估多种药物疗法对类器官的效果时，他们发现类器官对治疗的完全反应(肿瘤细胞本身的亡)是高度个体化的。换句话说，克里希纳斯瓦米说，不同的疗法会导致每个测试的类器官产生不同的结果。

“这个工具不仅可以帮助评估个体癌症患者的预后，还可以为他们建议最有效的癌症治疗方法，”她说。