在将粪便用作有机肥料的农业生态系统中，这些抗生素残留物对土壤微生物群落产生强大的选择压力。动物粪便中的抗生素抗性细菌(ARB)会增加土壤中ARB的浓度。土壤类型对ARB分布的影响机制值得进一步探讨。本研究表明，CTC-粪肥诱导潮土中土壤本土微生物产生更强的抗性，其中乳酸杆菌、戴氏菌属、拉尔斯通氏菌和芽孢杆菌是关键的不同属，粪便控制是降低土壤ARB风险的有效途径。研究人员的发现发表 在 2023 年 12 月 19 日的《土壤生态快报》上。

中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所针对ARB和抗生素抗性基因(ARGs)的风险开展了一系列研究。例如，他们发现Chloroflexi 与 ARGs 的去除密切相关，并且 ARGs 的潜在宿主细菌随不同的抗生素而变化。他们还发现，在含有抗生素的红壤中，多药耐药基因增加最多，而ARG直接受微生物影响，间接受土壤性质影响。

李教授表示，“农业生产给环境造成了沉重负担，总体恶化趋势还在加剧，这是必须解决的矛盾。日前公布的第二次全国污染源普查结果显示，农业源污染负荷超过工业和城市，凸显了农业环保工作的重要性和紧迫性。因此，我们选择并探索农业农村环保问题，希望为环境问题的解决贡献一份力量。”

在这项研究中，他们发现在潮土中观察到的操作分类单位和金霉素(CTC)抗性细菌(CRB)的群落组成比黑土和红土中的变化更大。 CTC诱导土壤本土微生物(链霉菌、假单胞菌、芽孢杆菌、红球菌和 类 芽孢杆菌)产生抗生素抗性，并且这种诱导在潮土中最为明显。此外，主要的不同属是微杆菌科(黑土)、乳杆菌属、未分类芽孢杆菌属和类芽孢杆菌属(潮土)以及Dyella属、拉尔斯顿氏菌属和芽孢杆菌属 (红土)。 结论是，与黑土和红土相比，施用粪肥导致潮土中 CRB 风险更高。这一结果表明，根据土壤类型采取适当的方法是降低粪便返还过程中土壤抗性细菌风险的重要方法。

李教授说：“向土壤中施用粪肥会增加微生物的抵抗力，当粪肥中含有抗生素残留时，这种抵抗力会更强。此外，与黑土和红壤相比，施用粪肥导致潮土中的CRB风险更高。因此，根据土壤类型科学施肥对于监测农业实践中的抗性风险也很重要。”

土壤与我们的生活息息相关;它对于粮食安全、水安全和整个生态系统健康至关重要。监测土壤抗生素风险比以往任何时候都更加重要。